Basecamp Research ने अपने EDEN जैविक मॉडलों का विस्तार करने और उपचार पाइपलाइन को क्लिनिकल विकास की ओर ले जाने के लिए $140 मिलियन जुटाए हैं। कंपनी का कहना है कि पर्यावरणीय नमूनों से बना उसका मालिकाना डेटा-संग्रह मॉडलों को ऐसी जैविक जानकारी देता है जो सार्वजनिक अनुक्रम डेटाबेस में नहीं मिलती।

इसके प्रमाणों में कंपनी-नेतृत्व वाले प्रयोगशाला परीक्षण और अलग से रिपोर्ट किया गया चूहों पर एक अध्ययन शामिल है। बताई गई उपचार पाइपलाइन अब भी शोध और लीड ऑप्टिमाइज़ेशन चरण में है।

बड़ा बदलाव

  • क्या बदला: जैविक मॉडल बनाने वाली कंपनी ने वैश्विक क्षेत्रीय नमूना-संग्रह, जीनोम का संदर्भ और मॉडल प्रशिक्षण को एक मालिकाना डेटा-श्रृंखला में जोड़ा, फिर बनाए गए प्रोटीनों को प्रयोगशाला में परखा।
  • यह क्यों मायने रखता है: दवा मरीजों तक पहुंचने से पहले ही प्रशिक्षण डेटा जैव-विविधता उपलब्ध कराने वाले साझेदारों के साथ व्यावसायिक संबंध बनाता है। Basecamp का कहना है कि उसके समझौतों के तहत डेटा के उपयोग पर रॉयल्टी मिलती है, इसलिए मॉडल विकास के दौरान भी संग्रह-साझेदारों को भुगतान हो सकता है।
  • क्या देखना है: देखें कि स्वतंत्र रूप से दोहराए गए नतीजे विकास के अगले चरण तक पहुंचते हैं या नहीं, और मॉडल का बढ़ता उपयोग संग्रह-साझेदारों को बड़े भुगतान दिलाता है या नहीं। ये उपचार संबंधी प्रगति और डेटा व्यवसाय की अलग-अलग कसौटियां हैं।

BaseData में अनुक्रमों के साथ संदर्भ भी है

सार्वजनिक रिपॉज़िटरी बेहद जरूरी हैं, लेकिन उनमें वही झलकता है जिसे शोधकर्ताओं ने अनुक्रमित करना चुना है। Basecamp का BaseData प्रीप्रिंट कहता है कि Sequence Read Archive में अनुक्रमों की 68% मात्रा पांच प्रजातियों से आई। 2024 के आखिर तक कंपनी ने बताया कि उसके पास 9.8 अरब नए जीन और तुलना वाले डेटाबेस में न मिलने वाली दस लाख से अधिक प्रजातियां थीं; ये 26 देशों और स्वायत्त क्षेत्रों में साझेदारियों के जरिए जुटाए गए।

Basecamp पास के जीन, स्थल की स्थितियां और नमूना-संग्रह का स्रोत भी दर्ज करता है, जिससे मॉडल को जैविक संदर्भ मिलता है। कंपनी के अनुसार, 2024 के अंत तक 19 देशों में 52 लाभार्थियों को भुगतान किया जा चुका था।

BaseData मालिकाना है। EDEN का प्रशिक्षण डेटा 2024 के आखिर के उस स्नैपशॉट से आगे बढ़ा: उसके प्रीप्रिंट में 10 अरब से अधिक जीन दर्ज हैं। दोनों शोधपत्र कंपनी-नेतृत्व वाले प्रीप्रिंट हैं।

सार्वजनिक डेटा भी आगे बढ़ रहा है। Microsoft के Dayhoff Atlas ने जीनोमिक और मेटाजीनोमिक स्रोतों को मिलाकर 3.34 अरब प्रोटीन अनुक्रमों का एक खुला संग्रह बनाया। नियंत्रित तुलना में, इस व्यापक संग्रह पर प्रशिक्षित 170 मिलियन पैरामीटर वाले मॉडल ने बनाए गए 34.5% प्रोटीन को E. coli में अभिव्यक्त किया, जबकि UniRef90 पर प्रशिक्षित मॉडल के लिए यह 27.6% था। यह अलग डेटा-सेट का प्रयोग है, Basecamp के मॉडलों का परीक्षण नहीं।

EDEN ने वास्तव में क्या दिखाया है

EDEN के प्रीप्रिंट में पहले से तय किए गए प्रयोग शामिल हैं, लेकिन हर नतीजा एक सीमित सवाल का जवाब देता है।

प्रयोग

बताया गया नतीजा

दायरा

रोगाणुरोधी पेप्टाइड

चुने गए 33 में से 32 पेप्टाइड ने 64 माइक्रोमोलर तक की सांद्रता पर बैक्टीरिया की वृद्धि रोकी।

चुना हुआ प्रयोगशाला समूह; 97% सभी आउटपुट की सफलता-दर नहीं है।

जीन प्रविष्टि प्रोटीन

चुने गए 176 रिकॉम्बिनेज़ में से 53.6% ने उल्लेखनीय सक्रियता दिखाई।

नौ प्राकृतिक प्रोटीनों के प्रॉम्प्ट का उपयोग करके किया गया कोशिका-मुक्त जैवरासायनिक परीक्षण।

प्राथमिक मानव T कोशिकाएं

चुने गए PRT075-आधारित 20 रिकॉम्बिनेज़ में से दस ने खाली कार्गो नियंत्रण से अधिक CD19 CAR पेलोड प्रविष्ट किया।

दाता से प्राप्त कोशिकाएं; विशिष्टता की आगे जांच होनी बाकी है।

चूहों पर अध्ययन

Basecamp की रिपोर्ट है कि एक पेप्टाइड ने बार-बार ऑप्टिमाइज़ किए बिना अंतिम विकल्प वाले एंटीबायोटिक जैसा असर दिखाया।

कंपनी की ओर से अलग से बताया गया पशु-प्रयोग।

पेप्टाइड के काम के लिए अब भी स्थिरता, विषाक्तता और फार्माकोकाइनेटिक्स के अध्ययन जरूरी हैं। ये प्रयोग क्लिनिकल सुरक्षा या प्रभावकारिता स्थापित नहीं करते।

क्लिनिक तक अभी लंबा रास्ता है

कंपनी का मौजूदा कनेक्टर शोधकर्ताओं को EDEN से रोगाणुरोधी पेप्टाइड बनाने और वैक्सीन लक्ष्य तय करने देता है। इस टूल को शोध-उपयोग के लिए बताया गया है।

The Decoder की पूरी रिपोर्ट के मुताबिक, Basecamp के बताए छह कार्यक्रमों में से कोई भी सितंबर 2026 तक लीड ऑप्टिमाइज़ेशन पूरा नहीं कर पाया था। चार उस चरण में थे, जिनमें शरीर के भीतर CAR-T कार्यक्रम, लिवर जीन थेरेपी और रोगाणुरोधी पेप्टाइड शामिल थे; दो अब भी शोध चरण में थे।

Basecamp की फंडिंग घोषणा कहती है कि नई पूंजी EDEN की अगली पीढ़ी को समर्थन देगी और पाइपलाइन को क्लिनिकल विकास की ओर बढ़ाएगी; शुरुआत शरीर के भीतर कोशिका-चिकित्सा से होगी। 23 सितंबर को ClinicalTrials.gov पर की गई खोज में प्रायोजक के नाम “Basecamp Research” के तहत कोई अध्ययन नहीं मिला। दूसरे प्रायोजक के नाम से दर्ज अध्ययन जरूरी नहीं कि इस खोज में दिखें।