Basecamp Research 完成 1.4 亿美元融资,用于扩展其 EDEN 生物模型,并推动疗法研发管线迈向临床开发。公司表示,通过环境采样建立的专有数据集,为模型提供了公共序列数据库所缺少的生物信息。

其证据包括公司主导的实验室实验,以及另行报告的一项小鼠研究。已披露的疗法管线仍处于研究和先导优化阶段。

重大变化

  • 变化内容:一家生物模型公司将全球实地采样、基因组上下文信息和模型训练整合进同一条专有数据供应链,并将生成的蛋白质送入湿实验室测试。
  • 为何重要:在药物到达患者之前,训练数据已经与生物多样性数据提供方形成商业关系。Basecamp 表示,如果数据被使用,相关协议会触发版税,因此采集合作方可在模型开发期间获得报酬。
  • 关注事项:关注能否通过独立重复验证,将研究结果推进到后续开发阶段;同时关注扩大模型使用是否会增加向数据采集合作方支付的款项。这是治疗研发进展和数据业务的两项独立检验。

BaseData 不仅提供序列,也提供上下文

公共数据库不可或缺,但它们反映的是研究人员选择测序的对象。Basecamp 的BaseData 预印本称,序列读取档案中的序列数据量有 68% 来自五个物种。截至 2024 年末,公司报告称,相对于用于比较的数据库,其采集数据中包含 98 亿个新基因和超过 100 万个未出现于这些数据库的物种,采集工作通过在 26 个国家和地区建立的合作关系开展。

Basecamp 还保留相邻基因、采集地点的环境条件及采集来源信息,为模型提供生物学上下文。据其报告,到 2024 年底,公司已向 19 个国家和地区的 52 个受益方支付款项。

BaseData 属于专有数据。EDEN 的训练数据集在 2024 年末的快照基础上继续扩大:其预印本报告称,基因数量已超过 100 亿。两篇论文均为公司主导的预印本。

公共数据也在不断发展。微软的Dayhoff Atlas将基因组和宏基因组来源的数据整合为一个包含 33.4 亿条蛋白质序列的开放数据集。在一项受控比较中,用这一更广泛数据集训练的 1.7 亿参数模型,有 34.5% 的生成蛋白质在大肠杆菌中表达;而使用 UniRef90 训练的模型为 27.6%。这是另一项数据集实验,并非对 Basecamp 模型的测试。

EDEN 实际展示了什么

EDEN 的预印本包含前瞻性实验,但每项结果回答的都只是一个范围有限的问题。

实验

报告的结果

范围

抗菌肽

在选出的 33 种肽中,有 32 种在最高 64 微摩尔浓度下抑制了细菌生长。

仅为一组经过筛选的实验室样本;97% 并非所有模型输出的成功率。

基因插入蛋白

在选出的 176 种重组酶中,53.6% 表现出显著活性。

使用九种天然蛋白质提示词开展的无细胞生化分析。

原代人类 T 细胞

在 20 种经筛选、基于 PRT075 的重组酶中,10 种插入了高于空载对照水平的 CD19 CAR 载荷。

来源于供体的细胞;其特异性仍有待进一步研究。

小鼠研究

Basecamp报告称,一种肽在未经过迭代优化的情况下,与一种效果达到一种末线抗生素的水平。关于动物实验的另一项公司报告。

肽类研究仍需要稳定性、毒性和药代动力学研究。这些实验不能证明临床安全性或疗效。

距离临床应用仍很远

该公司

当前的连接器允许研究人员使用 EDEN 生成抗菌肽并优先筛选疫苗靶点。产品页面将该工具标注为仅供研究使用。The Decoder 的完整报道

发现,截至 2026 年 9 月,Basecamp 已披露的六个项目中,没有一个完成先导优化。其中四个处于该阶段,包括体内 CAR-T 项目、肝脏基因疗法和抗菌肽;另外两个仍处于研究阶段。Basecamp 的

融资公告表示,新资金将用于支持下一代 EDEN,并推动其研发管线迈向临床开发,首先从体内细胞疗法开始。9 月 23 日对 ClinicalTrials.gov 的查询没有返回以“Basecamp Research”为申办方的研究;以其他申办方注册的研究未必会出现在该结果中。在 Basecamp Research 内部,AI 初创公司如何将进化转化为训练数据