EDEN జీవశాస్త్ర నమూనాలను విస్తరించి, ఒక చికిత్సా అభివృద్ధి మార్గాన్ని క్లినికల్ అభివృద్ధి దిశగా తీసుకెళ్లేందుకు Basecamp Research $140 మిలియన్ల నిధులు సమీకరించింది. పర్యావరణ నమూనాల సేకరణతో నిర్మించిన స్వంత డేటా సమాహారంలో, పబ్లిక్ క్రమ-డేటాబేస్‌లలో లేని జీవశాస్త్ర సమాచారం ఉందని కంపెనీ చెబుతోంది.
కంపెనీ నిర్వహించిన ప్రయోగశాల పరీక్షలు, విడిగా నివేదించిన ఎలుకల అధ్యయనం దాని ఆధారాల్లో ఉన్నాయి. చికిత్సల అభివృద్ధి మార్గం పరిశోధన, లీడ్ ఆప్టిమైజేషన్ దశల్లోనే ఉంది.
పెద్ద మార్పు
- ఏం మారింది: జీవశాస్త్ర నమూనాలు రూపొందించే కంపెనీ, ప్రపంచవ్యాప్త క్షేత్ర సేకరణ, జన్యు సందర్భ సమాచారం, నమూనా శిక్షణను ఒకే స్వంత డేటా సరఫరా వ్యవస్థలో కలిపింది. ఆ తర్వాత నమూనాలతో రూపొందించిన ప్రోటీన్‌లను ప్రయోగశాలలో పరీక్షించింది.
- ఇది ఎందుకు ముఖ్యం: ఔషధం రోగులకు చేరకముందే శిక్షణ డేటా జీవవైవిధ్యాన్ని అందించే భాగస్వాములతో వాణిజ్య సంబంధాన్ని ఏర్పరుస్తుంది. డేటాను ఉపయోగించినప్పుడు తమ ఒప్పందాల ప్రకారం రాయల్టీలు చెల్లిస్తామని Basecamp చెబుతోంది; అందువల్ల నమూనా అభివృద్ధి సమయంలోనే సేకరణ భాగస్వాములకు చెల్లింపు అందవచ్చు.
- ఏం గమనించాలి: స్వతంత్రంగా పునరుత్పత్తి చేసిన ఫలితాలు అభివృద్ధి దశల్లో పురోగతికి దారితీస్తాయా, నమూనాల విస్తృత వినియోగంతో సేకరణ భాగస్వాములకు చెల్లింపులు పెరుగుతాయా అనేది చూడాలి. ఇవి చికిత్సా పురోగతి, డేటా వ్యాపారానికి సంబంధించిన వేర్వేరు పరీక్షలు.
BaseData క్రమాలతో పాటు సందర్భ సమాచారాన్నీ జోడిస్తుంది
పబ్లిక్ భాండాగారాలు ఎంతో అవసరం; అయితే పరిశోధకులు క్రమపరచాలని ఎంచుకున్నవాటినే అవి ప్రతిబింబిస్తాయి. Basecamp BaseData ప్రీప్రింట్ ప్రకారం, Sequence Read Archiveలోని క్రమాల పరిమాణంలో 68% ఐదు జాతుల నుంచే వచ్చింది. 2024 చివరి నాటికి, పోలికకు ఉపయోగించిన డేటాబేస్‌లలో లేని 9.8 బిలియన్ కొత్త జన్యువులు, పది లక్షలకు పైగా జాతులను 26 దేశాలు, స్వయంపాలిత ప్రాంతాల్లోని భాగస్వామ్యాల ద్వారా సేకరించినట్లు కంపెనీ తెలిపింది.
Basecamp పొరుగు జన్యువులు, ప్రదేశ పరిస్థితులు, సేకరణ మూల వివరాలనూ భద్రపరుస్తుంది. దీంతో నమూనాలకు జీవశాస్త్ర సందర్భ సమాచారం అందుతుంది. 2024 చివరి నాటికి 19 దేశాల్లోని 52 మంది లబ్ధిదారులకు చెల్లించినట్లు తెలిపింది.
BaseData స్వంత డేటాసెట్. 2024 చివరి నాటి గణాంకాల తర్వాత EDEN శిక్షణ సమాహారం పెరిగింది: దాని ప్రీప్రింట్‌లో 10 బిలియన్లకు పైగా జన్యువులున్నాయని పేర్కొన్నారు. ఈ రెండు పత్రాలూ కంపెనీ నేతృత్వంలో రూపొందిన ప్రీప్రింట్లు.
పబ్లిక్ డేటా కూడా పెరుగుతోంది. Microsoft రూపొందించిన Dayhoff Atlas జన్యు, మెటాజీనోమిక్ మూలాలను కలిపి 3.34 బిలియన్ ప్రోటీన్ క్రమాలతో ఓపెన్ డేటాసెట్‌ను రూపొందించింది. నియంత్రిత పోలికలో, ఆ విస్తృత డేటాసెట్‌పై శిక్షణ పొందిన 170 మిలియన్ పరామితుల నమూనా రూపొందించిన ప్రోటీన్‌లలో 34.5% E. coliలో వ్యక్తమయ్యాయి. UniRef90పై శిక్షణ పొందిన నమూనాలో ఈ రేటు 27.6%. ఇది వేరే డేటాసెట్‌పై చేసిన ప్రయోగం; Basecamp నమూనాల పరీక్ష కాదు.
EDEN వాస్తవంగా ఏమి చూపించింది
ఈ EDEN ప్రీప్రింట్ ముందుచూపుతో రూపొందించిన ప్రయోగాలను వివరిస్తుంది; అయితే ప్రతి ఫలితం పరిమితమైన ఒక ప్రశ్నకే సమాధానం ఇస్తుంది.
ప్రయోగం | నివేదించిన ఫలితం | వర్తించే పరిధి |
|---|---|---|
యాంటీమైక్రోబియల్ పెప్టైడ్‌లు | ఎంపిక చేసిన 33 పెప్టైడ్‌లలో 32, 64 మైక్రోమోలార్ వరకు గాఢత వద్ద బ్యాక్టీరియా పెరుగుదలను అడ్డుకున్నాయి. | ఎంపిక చేసిన ప్రయోగశాల సమూహం; 97% అనేది అన్ని నమూనా ఫలితాల విజయ రేటు కాదు. |
జన్యు చొప్పింపు ప్రోటీన్‌లు | ఎంపిక చేసిన 176 రీకాంబినేజ్‌లలో 53.6% గణనీయమైన చురుకుదనాన్ని చూపాయి. | తొమ్మిది సహజ ప్రోటీన్‌ల ప్రేరణలతో చేసిన కణరహిత జీవరసాయన పరీక్ష. |
ప్రాథమిక మానవ T కణాలు | ఎంపిక చేసిన PRT075 ఆధారిత 20 రీకాంబినేజ్‌లలో పది, ఖాళీ కార్గో నియంత్రణ కంటే ఎక్కువగా CD19 CAR కార్గోను చొప్పించాయి. | దాతల నుంచి పొందిన కణాలు; ప్రత్యేకతపై మరింత పరిశోధన అవసరం. |
ఎలుకల అధ్యయనం | Basecamp నివేదించిన ప్రకారం, ఒక పెప్టైడ్ పదే పదే ఆప్టిమైజేషన్ చేయకుండానే చివరి ప్రత్యామ్నాయ యాంటీబయాటిక్‌తో సమాన ఫలితమిచ్చింది. | జంతువులపై చేసిన ప్రయోగానికి సంబంధించి కంపెనీ విడిగా ఇచ్చిన నివేదిక. |
పెప్టైడ్‌లపై చేసిన ఈ పనికి ఇంకా స్థిరత్వం, విషతుల్యత, ఫార్మకోకైనెటిక్ అధ్యయనాలు అవసరం. ఈ ప్రయోగాలు క్లినికల్ భద్రతను లేదా సమర్థతను నిరూపించవు.
క్లినికల్ వినియోగానికి దూరం ఇంకా ఎక్కువే
కంపెనీ యొక్క ప్రస్తుత కనెక్టర్ యాంటీమైక్రోబియల్ పెప్టైడ్‌లను రూపొందించడానికి, టీకా లక్ష్యాలకు ప్రాధాన్యం నిర్ణయించడానికి EDENను ఉపయోగించేందుకు పరిశోధకులకు వీలు కల్పిస్తుంది. ఈ సాధనం పరిశోధన కోసమేనని అది స్పష్టం చేస్తుంది.
The Decoder పూర్తి నివేదిక ప్రకారం, 2026 సెప్టెంబరు నాటికి Basecamp వెల్లడించిన ఆరు కార్యక్రమాల్లో ఏదీ లీడ్ ఆప్టిమైజేషన్ దశను దాటి ముందుకు వెళ్లలేదు. శరీరంలోనే పనిచేసే CAR-T కార్యక్రమాలు, కాలేయ జన్యు చికిత్స, యాంటీమైక్రోబియల్ పెప్టైడ్‌లతో సహా నాలుగు ఆ దశలో ఉన్నాయి; మరో రెండు పరిశోధన దశలోనే ఉన్నాయి.
Basecamp నిధుల ప్రకటన ప్రకారం, కొత్త పెట్టుబడి EDEN తదుపరి తరాన్ని అభివృద్ధి చేయడానికీ, శరీరంలోనే కణ చికిత్సతో మొదలుపెట్టి చికిత్సల మార్గాన్ని క్లినికల్ అభివృద్ధి దిశగా తీసుకెళ్లడానికీ ఉపయోగిస్తామని చెబుతోంది. సెప్టెంబరు 23న ClinicalTrials.govలో చేసిన శోధన ఫలితాల్లో “Basecamp Research” స్పాన్సర్ పేరుతో ఎలాంటి అధ్యయనమూ కనిపించలేదు. ఇతర స్పాన్సర్ల పేర్లతో నమోదు చేసిన అధ్యయనాలు ఈ శోధనలో తప్పనిసరిగా కనిపించవు.
