Basecamp Research menghimpun US$140 juta untuk mengembangkan model biologi EDEN dan membawa salah satu jalur terapinya menuju pengembangan klinis. Perusahaan mengatakan korpus eksklusif yang dibangun melalui pengambilan sampel lingkungan memberi modelnya informasi biologis yang tidak tersedia dalam basis data sekuens publik.
Bukti yang dipaparkan mencakup eksperimen laboratorium yang dipimpin perusahaan dan studi tikus yang dilaporkan secara terpisah. Jalur terapi yang diungkapkan masih berada pada tahap riset dan optimasi kandidat.
Perubahan besar
- Yang berubah: Perusahaan model biologi ini menggabungkan pengambilan sampel lapangan secara global, konteks genomik, dan pelatihan model dalam satu rantai pasok data eksklusif, lalu menguji protein yang dihasilkan di laboratorium.
- Mengapa ini penting: Data pelatihan menciptakan hubungan komersial dengan penyedia keanekaragaman hayati sebelum suatu obat mencapai pasien. Basecamp mengatakan perjanjiannya memicu pembayaran royalti ketika data digunakan, sehingga mitra pengumpulan dapat menerima bayaran selama pengembangan model.
- Yang perlu dipantau: Amati apakah hasil yang direplikasi secara independen menghasilkan kemajuan menuju tahap pengembangan berikutnya, serta apakah perluasan penggunaan model meningkatkan pembayaran kepada mitra pengumpulan. Keduanya merupakan ukuran terpisah bagi kemajuan terapi dan bisnis data.
BaseData menambahkan konteks, bukan sekadar sekuens
Repositori publik sangat penting, tetapi isinya mencerminkan apa yang dipilih peneliti untuk disekuensing. Pracetak BaseData menyebut 68% volume sekuens di Sequence Read Archive berasal dari lima spesies. Hingga akhir 2024, perusahaan melaporkan 9,8 miliar gen baru dan lebih dari satu juta spesies yang tidak terdapat dalam basis data pembanding, dikumpulkan melalui kemitraan di 26 negara dan wilayah otonom.
Basecamp juga mempertahankan informasi tentang gen yang berdekatan, kondisi lokasi, dan asal-usul sampel, sehingga model memperoleh konteks biologis. Perusahaan melaporkan telah membayar 52 penerima manfaat di 19 negara hingga akhir 2024.
BaseData adalah data eksklusif. Korpus pelatihan EDEN telah bertambah sejak potret akhir 2024 tersebut: pracetaknya melaporkan lebih dari 10 miliar gen. Kedua makalah ini merupakan pracetak yang dipimpin perusahaan.
Data publik juga terus berkembang. Dayhoff Atlas dari Microsoft menggabungkan sumber genomik dan metagenomik menjadi kumpulan terbuka berisi 3,34 miliar sekuens protein. Dalam perbandingan terkontrol, model berparameter 170 juta yang dilatih dengan kumpulan data lebih luas itu mengekspresikan 34,5% protein yang dihasilkan di E. coli, dibandingkan 27,6% untuk versi yang dilatih dengan UniRef90. Ini adalah eksperimen dengan kumpulan data terpisah, bukan pengujian atas model Basecamp.
Apa yang benar-benar telah ditunjukkan EDEN
Pracetak EDEN memuat eksperimen prospektif, tetapi setiap hasil menjawab pertanyaan yang terbatas.
Eksperimen | Hasil yang dilaporkan | Cakupan |
|---|---|---|
Peptida antimikroba | 32 dari 33 peptida terpilih menghambat pertumbuhan bakteri pada konsentrasi hingga 64 mikromolar. | Kumpulan terpilih di laboratorium; angka 97% bukan tingkat keberhasilan seluruh keluaran. |
Protein penyisip gen | 53,6% dari 176 rekombinase terpilih menunjukkan aktivitas signifikan. | Uji biokimia bebas sel menggunakan prompt dari sembilan protein alami. |
Sel T primer manusia | Sepuluh dari 20 rekombinase terpilih berbasis PRT075 menyisipkan muatan CAR CD19 melebihi kontrol muatan kosong. | Sel yang berasal dari donor; spesifisitas masih perlu diselidiki lebih lanjut. |
Studi pada tikus | Basecamp melaporkan bahwa satu peptida menyamai antibiotik lini terakhir tanpa optimasi berulang. | Laporan perusahaan yang terpisah tentang eksperimen hewan. |
Pekerjaan terkait peptida masih memerlukan studi stabilitas, toksisitas, dan farmakokinetika. Eksperimen ini tidak membuktikan keamanan atau kemanjuran klinis.
Jarak menuju penggunaan klinis masih jauh
Konektor yang tersedia saat ini dari perusahaan memungkinkan peneliti menggunakan EDEN untuk menghasilkan peptida antimikroba dan menentukan prioritas target vaksin. Produk itu ditandai untuk penggunaan riset.
Laporan lengkap The Decoder menemukan bahwa per September 2026, tidak satu pun dari enam program yang diungkapkan Basecamp telah melewati tahap optimasi kandidat. Empat program berada pada tahap tersebut, termasuk program CAR-T in vivo, terapi gen hati, dan peptida antimikroba; dua lainnya masih dalam tahap riset.
Pengumuman pendanaan Basecamp menyebut modal baru ini akan mendukung generasi EDEN berikutnya dan memajukan jalur pengembangannya menuju tahap klinis, dimulai dengan terapi sel in vivo. Pencarian ClinicalTrials.gov pada 23 September tidak menemukan studi dengan nama sponsor “Basecamp Research”; studi yang didaftarkan di bawah sponsor lain belum tentu muncul dalam hasil tersebut.
