Basecamp ने EDEN च्या प्रयोगशाळेतील निकालांना उपचारांकडे नेण्यासाठी $140 दशलक्ष उभारले

EDEN जैविक मॉडेल्सचा विस्तार करण्यासाठी आणि उपचार-पाइपलाइनला वैद्यकीय विकासाकडे नेण्यासाठी Basecamp Research ने $140 दशलक्ष उभारले. पर्यावरणीय नमुने गोळा करून तयार केलेल्या मालकीच्या डेटासंचातून सार्वजनिक अनुक्रम-संग्रहांत नसलेली जैविक माहिती मॉडेल्सना मिळते, असे कंपनी सांगते.

पुराव्यांत कंपनीच्या नेतृत्वाखालील प्रयोगशाळीय चाचण्या आणि स्वतंत्रपणे नोंदवलेला उंदरांवरील अभ्यास आहे. जाहीर केलेली उपचार-पाइपलाइन अजून संशोधन आणि आघाडीच्या उमेदवारांच्या अनुकूलनाच्या टप्प्यावर आहे.

मोठा बदल

• काय बदलले: जैविक-मॉडेल कंपनीने जागतिक क्षेत्रीय नमुना-संकलन, जनुकीय संदर्भ आणि मॉडेल-प्रशिक्षण एका मालकीच्या डेटा-साखळीत जोडले; नंतर तयार केलेली प्रथिने प्रयोगशाळेत तपासली.
• हे का महत्त्वाचे: औषध रुग्णांपर्यंत पोहोचण्यापूर्वीच प्रशिक्षण-डेटामुळे जैवविविधता जपणाऱ्या भागीदारांशी व्यावसायिक संबंध निर्माण होतो. डेटा वापरल्यास करारांनुसार रॉयल्टी मिळते, त्यामुळे मॉडेल-विकासादरम्यान संकलन-भागीदारांना मोबदला मिळतो, असे Basecamp सांगते.
• कशाकडे लक्ष द्यावे: स्वतंत्रपणे पुनरुत्पादित निकाल विकासाच्या पुढील टप्प्यांत प्रगती करतात का आणि मॉडेलचा अधिक वापर झाल्यास संकलन-भागीदारांना मोठी देयके मिळतात का, हे पाहा. उपचारांतील प्रगती आणि डेटा-व्यवसायासाठी या स्वतंत्र कसोट्या आहेत.

BaseData मध्ये अनुक्रमांसह संदर्भही आहे

सार्वजनिक संग्रह अत्यावश्यक आहेत; मात्र संशोधकांनी काय अनुक्रमित करायचे निवडले त्याचेच ते प्रतिबिंब असतात. Basecamp च्या BaseData संशोधनपूर्व लेखानुसार Sequence Read Archive मधील अनुक्रम-आकडेवारीच्या ६८% नोंदी पाच प्रजातींच्या होत्या. २०२४ अखेरपर्यंत तुलनात्मक डेटाबेसमध्ये नसलेली ९.८ अब्ज नवी जनुके आणि दहा लाखांहून अधिक प्रजाती २६ देश व स्वायत्त प्रदेशांतील भागीदारीतून गोळा केल्याचे कंपनीने सांगितले.

Basecamp शेजारील जनुके, संकलन-स्थळाची परिस्थिती आणि नमुन्याचा उगम यांचीही नोंद ठेवते; त्यामुळे मॉडेल्सना जैविक संदर्भ मिळतो. २०२४ अखेरपर्यंत १९ देशांतील ५२ लाभार्थ्यांना देयके दिल्याचे कंपनीने नोंदवले.

BaseData हा मालकीचा डेटासंच आहे. २०२४ अखेरच्या त्या आकडेवारीनंतर EDEN चा प्रशिक्षण-संच वाढला: संशोधनपूर्व लेखात दहा अब्जांहून अधिक जनुकांचा उल्लेख आहे. दोन्ही लेख कंपनीच्या नेतृत्वाखालील संशोधनपूर्व प्रकाशने आहेत.

सार्वजनिक डेटाही वाढत आहे. Microsoft चा Dayhoff Atlas जीनोमिक आणि मेटाजीनोमिक स्रोतांतील ३.३४ अब्ज प्रथिन-अनुक्रमांचा खुला संच एकत्र करतो. नियंत्रित तुलनेत त्या व्यापक संचावर प्रशिक्षित १७ कोटी पॅरामीटरच्या मॉडेलने तयार केलेल्या प्रथिनांपैकी ३४.५% E. coliमध्ये व्यक्त झाले; UniRef90 वर प्रशिक्षित आवृत्तीसाठी हा आकडा २७.६% होता. हा Basecamp च्या मॉडेल्सवर नव्हे तर वेगळ्या डेटासंचावरचा प्रयोग आहे.

EDEN ने प्रत्यक्षात काय दाखवले

EDEN च्या संशोधनपूर्व लेखात संभाव्य प्रयोग दिले आहेत; मात्र प्रत्येक निकाल एका मर्यादित प्रश्नाचे उत्तर देतो.

पेप्टाइडसाठी स्थैर्य, विषारीपणा आणि शरीरातील औषध-गतीशास्त्राच्या चाचण्या अजून आवश्यक आहेत. या प्रयोगांत उपचारांची वैद्यकीय सुरक्षितता किंवा परिणामकारकता सिद्ध होत नाही.

वैद्यकीय वापरापर्यंतचे अंतर मोठे आहे

कंपनीचे सध्याचे connector संशोधकांना EDEN वापरून प्रतिजैविक पेप्टाइड तयार करण्याची आणि लसीचे लक्ष्य प्राधान्याने निवडण्याची सुविधा देते. उत्पादन संशोधनासाठी असल्याचे स्पष्ट नमूद आहे.

The Decoder च्या सविस्तर वृत्तांतात सप्टेंबर २०२६ पर्यंत Basecamp च्या जाहीर सहा कार्यक्रमांपैकी एकही उमेदवार-अनुकूलन टप्पा पार केलेला नव्हता. चार त्या टप्प्यावर होते; त्यात शरीरातील CAR-T उपचार, यकृतासाठी जनुक-उपचार आणि प्रतिजैविक पेप्टाइड्स होते. दोन अजून संशोधनात होते.

Basecamp च्या निधी उभारणीच्या घोषणेत नवे भांडवल EDEN ची पुढील आवृत्ती तयार करण्यासाठी आणि पाइपलाइनला वैद्यकीय विकासाकडे नेण्यासाठी वापरले जाईल, सुरुवात शरीरातील पेशी-उपचारांपासून, असे म्हटले आहे. २३ सप्टेंबरच्या ClinicalTrials.gov शोधात “Basecamp Research” या प्रायोजक-नावाखाली अभ्यास सापडला नाही. अन्य प्रायोजकांखाली नोंदवलेले अभ्यास दिसतीलच असे नाही.