बॅक्टेरियोफेजच्या DNA मध्ये दुर्लक्षित राहिलेली रचना Claude ने ओळखली, असे Anthropic सांगते: रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेज जनुकाशेजारी जोडीदार जनुक आणि पुनरावृत्तींची लांब मालिका. बॅक्टेरियोफेज हे जीवाणूंना संक्रमित करणारे विषाणू आहेत; रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेज RNA ची DNA मध्ये प्रत बनवणारे एंझाइम आहेत. या प्रस्तावित कुटुंबाला कंपनी array-associated reverse transcriptases, किंवा ART, म्हणते. त्याच्या २३ सप्टेंबरच्या घोषणेत या पुनरावृत्ती नमुन्याची तुलना CRISPR शी केली आहे—जनुकीय संपादनाच्या प्रचलित साधनांमागील जीवाणूंची प्रणाली.

ही तुलना जनुकीय अनुक्रमाचा आकार सांगते. Anthropic च्या संशोधनपूर्व लेखात पुनरावृत्ती-संचातून लघु RNA तयार होतात याचे पुरावे दिले आहेत; मात्र ART रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेज सक्रिय आहे का, ते हे RNA वापरते का किंवा फेजसाठी ही प्रणाली काय करते, हे पथकाने अद्याप दाखवलेले नाही. प्रोग्राम करता येण्याजोग्या संपादनाचे प्रात्यक्षिक नोंदलेले नाही.

मोठा बदल

  • काय बदलले: कंपनीच्या नेतृत्वाखालील या अभ्यासात मोठ्या अनुक्रम-शोधादरम्यान AI एजंट्सना तपासण्यास सांगितलेल्या प्रथिन-वैशिष्ट्यांच्या बाहेरचा DNA नमुना दिसला. त्यानंतर मानवी संशोधकांनी उमेदवाराचा अभ्यास करून त्यातून तयार होणारे RNA मोजले.
  • हे का महत्त्वाचे: मोठ्या जनुक-संग्रहात शोध घेणारे संशोधक प्रयोगशाळेत पुढे तपासण्यासाठी एजंटच्या मदतीने असामान्य रचना शोधू शकतात. येथे एजंटचे योगदान म्हणजे काही प्रयोगात्मक आधार असलेला संशोधनाचा धागा; एंझाइमची क्रिया आणि जैविक भूमिका अजूनही अनुत्तरित प्रश्न आहेत.
  • कशाकडे लक्ष द्यावे: पुढील निर्णायक निकालांत प्रथिन रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेज म्हणून काम करते का, लघु RNA त्याचे सब्स्ट्रेट आहेत का आणि जोडीदार प्रथिनाची भूमिका काय हे तपासावे लागेल. ART काय करते हे कळल्यावरच संपादनातील उपयोगाचा कोणताही दावा तपासता येईल.

अनुक्रमात Claude ला काय आढळले

Anthropic मधील पीटर यून आणि सहलेखकांचा संशोधनपूर्व लेख सुमारे १.९ अब्ज प्रथिन-क्लस्टरच्या शोधाचे वर्णन करतो. Claude Mythos 5 वापरणाऱ्या एजंट्सनी सुमारे २,००,००० रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेज क्लस्टर शोधले आणि जवळच्या उमेदवार जनुकांचा तपास केला. लेखकांच्या मते ही मोहीम ९४९ एजंट-सत्रांत २१.५ तास चालली. मानवी वैज्ञानिकांनी संशोधनाची रूपरेषा आखली; एजंट्सनी संगणकीय शोध केला आणि आढाव्यासाठी अहवाल दिले.

एका एजंटने फेज रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेजलगतच्या DNA मधील अनपेक्षित धाग्याचा माग घेतला. त्याला वेगवेगळ्या अनुक्रमांनी विभागलेली पुनरावृत्तींची मालिका दिसली; त्याने त्यांतील अंतर तपासून ज्ञात प्रणालींशी तुलना केली. रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेजचा आधीच्या कामांत उल्लेख झाला होता. नव्या शोधाचा दावा म्हणजे त्या प्रथिनाचा पुनरावृत्ती-संच आणि जवळच्या जोडीदार जनुकासोबतचा संयोग; त्या जनुकाचे कार्यही अज्ञात आहे.

संशोधकांना संबंधित रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेजचे ९५ क्लस्टर सापडले; त्यांपैकी २८ च्या शेजारी ओळखता येण्याजोगे पुनरावृत्ती-संच होते. या पुनरावृत्ती CRISPR संचाच्या एका दिसणाऱ्या वैशिष्ट्यासारख्या आहेत; तरी आसपास cas जनुके नसल्याचे आणि मधल्या अनुक्रमांतील अंतर व जतन होण्यात फरक असल्याचे लेखात म्हटले आहे. त्यामुळे अनुक्रमातील साम्य हा तपासाचा धागा आहे; ART मध्ये CRISPR चीच यंत्रणा आहे याचा पुरावा नाही.

प्रयोगांतून काय सिद्ध होते

संशोधकांनी फेज SA1 संसर्गाच्या २०२२ मधील अभ्यासातील RNA माहितीचे नव्याने विश्लेषण केले. त्यांच्या विश्लेषणात संसर्गादरम्यान ART पुनरावृत्ती-संचाचे ट्रान्सक्रिप्शन झाले आणि त्यातून कमी लांबीचे RNA प्रकार तयार झाले. स्वतंत्र प्रयोगशाळीय अभिव्यक्ती-प्रयोगातही संचातून आलेले लघु RNA दिसल्याचे त्यांनी सांगितले. हे निरीक्षणे वेगवेगळे RNA अस्तित्वात असल्याला आधार देतात.

प्रस्तावित यंत्रणेतील पुढील टप्पे मात्र सिद्ध होत नाहीत. संशोधनपूर्व लेखाच्या चर्चेत रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेजची क्रिया किंवा संचातील RNA हे त्याचे सब्स्ट्रेट असल्याचे दाखवलेले नाही, असे लेखक स्पष्ट सांगतात. जोडीदार प्रथिनाशी परस्परक्रिया आणि फेजमधील प्रणालीची भूमिका याही अनुत्तरित आहेत. रेट्रॉनसारखे मॉडेल ही गृहीतकल्पना आहे. ART निवडक DNA लक्ष्य कापते किंवा संपादित करते असा दावा त्यावरून करता येत नाही.

Anthropic ने CRISPR संशोधक फेंग झांग यांची टिप्पणी प्रसिद्ध केली. त्यांनी संशोधनपूर्व लेखाचा आढावा घेतला आणि रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्टेजशी संबंधित RNA-पुनरावृत्ती संच रोचक असल्याचे म्हटले. पुढील तपासणी करणे योग्य आहे, एवढाच त्यांचा निष्कर्ष होता. हे स्वतंत्र पुनरुत्पादनाचा अहवाल नव्हता किंवा ART हे जनुक-संपादन साधन असल्याचा निष्कर्ष नव्हता.

पुनरावृत्तीक्षमतेची मर्यादा असलेला शोध-धागा

AI शोधपद्धतीचीही लेखात चाचणी केली आहे. लेखकांनी नोंदवलेल्या व्यापक मोहिमेच्या दहा पुनर्चाचण्यांत एजंट्सना हा पुनरावृत्ती-संच सापडला नाही. संबंधित DNA थेट मॉडेलच्या संदर्भात दिलेल्या मर्यादित चाचण्यांत अधिक सक्षम मॉडेल्सनी तो बऱ्याचदा ओळखला. अनुक्रम साधनांमागील फाइल्समध्ये असताना काही प्रयत्नांत नमुना दिसण्यासाठी पुरेसा DNA वाचलाच गेला नाही. हा फरक महत्त्वाचा आहे: वैशिष्ट्य समोर आल्यावर मॉडेल ते ओळखू शकले, पण पूर्ण शोधप्रक्रियेत योग्य अनुक्रम विश्वासार्हपणे त्यांच्या लक्षात आणून दिला गेला नाही.

कंपनीच्या नेतृत्वाखालील या संशोधनपूर्व लेखामुळे इतर संशोधकांना तपासता आणि पुढे विकसित करता येईल अशी विशिष्ट अनुक्रम-रचना आणि RNA निरीक्षणे उपलब्ध झाली आहेत. २३ सप्टेंबरपर्यंत येथे पाहिलेल्या स्रोतांत स्वतंत्र पुनरुत्पादन नोंदलेले नाही. ART ही अशी उमेदवार प्रणाली आहे जिचे कार्य अजून ठरलेले नाही.