బ్యాక్టీరియోఫేజ్ DNAలో ఇంతకుముందు పట్టించుకోని అమరికను Claude గుర్తించిందని Anthropic చెబుతోంది: భాగస్వామి జన్యువు, పొడవైన పునరావృత శ్రేణి పక్కన reverse transcriptase జన్యువు ఉంది. బ్యాక్టీరియోఫేజ్‌లు బ్యాక్టీరియాను సంక్రమించే వైరస్‌లు; reverse transcriptaseలు RNAను DNAగా కాపీ చేసే ఎంజైమ్‌లు. ప్రతిపాదిత కుటుంబానికి array-associated reverse transcriptases లేదా ART అని కంపెనీ పేరు పెట్టింది. దాని సెప్టెంబర్ 23 ప్రకటన ఈ పునరావృత నమూనాను, విస్తృతంగా వాడే జన్యు-సవరణ సాధనాలకు ఆధారమైన బ్యాక్టీరియా CRISPR వ్యవస్థతో పోలుస్తుంది.

ఈ పోలిక జన్యు శ్రేణి ఆకారాన్ని వివరిస్తుంది. Anthropic పరిశోధనా ప్రీప్రింట్ ఆ శ్రేణి చిన్న RNAలను ఉత్పత్తి చేస్తుందనే ఆధారాలను నివేదిస్తుంది; అయితే ART reverse transcriptase క్రియాశీలమని, ఆ RNAలను ఉపయోగిస్తుందని లేదా ఫేజ్‌లో ఈ వ్యవస్థ ఏమి చేస్తుందో ఇంకా చూపలేదని చెబుతుంది. ప్రోగ్రామబుల్ జన్యు సవరణను ప్రదర్శించినట్లు నివేదిక లేదు.

పెద్ద మార్పు

  • ఏం మారింది: కంపెనీ నేతృత్వంలోని ఈ అధ్యయనంలో, పెద్ద శ్రేణి శోధన చేస్తున్న AI ఏజెంట్‌లకు పరిశీలించమని చెప్పిన ప్రోటీన్ లక్షణాలకు వెలుపల ఉన్న DNA నమూనా కనిపించింది. మానవ పరిశోధకులు ఆ అభ్యర్థిని పరిశీలించి, దాని RNA ఉత్పత్తిని కొలిచారు.
  • ఇది ఎందుకు ముఖ్యం: విస్తారమైన జన్యు డేటాబేస్‌లను వెతికే పరిశోధకులు, ప్రయోగశాలలో మరింత పరిశీలించాల్సిన అసాధారణ అమరికలను ఏజెంట్‌ల ద్వారా గుర్తించవచ్చు. ఇక్కడ AI అందించినది ప్రయోగ ఆధారాలు కొంత ఉన్న పరిశోధనా సూచన మాత్రమే; ఎంజైమ్ చర్య, జీవసంబంధ పాత్ర ఇంకా తెలియదు.
  • ఏం గమనించాలి: తదుపరి నిర్ణయాత్మక ఫలితాలు ప్రోటీన్ reverse transcriptaseగా పనిచేస్తుందా, చిన్న RNAలు దాని ఉపపదార్థాలా, భాగస్వామి ప్రోటీన్ ఎలా పాలుపంచుకుంటుందా అన్నవి. ART ఏమి చేస్తుందో తెలుసుకున్న తర్వాతే జన్యు-సవరణ వినియోగం గురించిన వాదనను అంచనా వేయగలం.

శ్రేణిలో Claude ఏమి గుర్తించింది

Anthropicలో Peter Yoon, సహచరులు రాసిన ప్రీప్రింట్ సుమారు 1.9 బిలియన్ ప్రోటీన్ క్లస్టర్‌ల శోధనను వివరిస్తుంది. Claude Mythos 5పై నడిచిన ఏజెంట్‌లు సుమారు 200,000 reverse transcriptase క్లస్టర్‌లను గుర్తించి, సమీపంలో కనిపించిన అభ్యర్థి జన్యువులను పరిశీలించాయి. రచయితల ప్రకారం ఈ శోధన 949 ఏజెంట్ సెషన్‌లలో 21.5 గంటలు సాగింది. మానవ శాస్త్రవేత్తలు పరిశోధనా లక్ష్యాన్ని నిర్దేశించగా, ఏజెంట్‌లు గణన శోధన చేసి సమీక్షకు నివేదికలు సమర్పించాయి.

ఒక ఏజెంట్, ఫేజ్ reverse transcriptase పక్కనున్న DNAలో ఊహించని సూచనను అనుసరించింది. వేర్వేరు భాగాలతో విడిపోయిన పునరావృత శ్రేణిని గమనించి, వాటి మధ్య దూరాన్ని పరిశీలించి, తెలిసిన వ్యవస్థలతో అమరికను పోల్చింది. reverse transcriptaseను మునుపటి పరిశోధనల్లోనే గుర్తించారు. కొత్తదని చెప్పబడుతున్నది ఆ ప్రోటీన్, పునరావృత శ్రేణి, సమీప భాగస్వామి జన్యువు కలయిక; ఆ భాగస్వామి పని కూడా తెలియదు.

సంబంధిత reverse transcriptase క్లస్టర్‌లు 95 ఉన్నాయని, వాటిలో 28 పక్కన గుర్తించగల శ్రేణులు ఉన్నాయని పరిశోధకులు కనుగొన్నారు. ఆ పునరావృతాలు CRISPR శ్రేణుల కనిపించే ఒక లక్షణాన్ని పోలి ఉంటాయి; అయినా సమీపంలో cas జన్యువులేవీ లేవని, మధ్యనున్న శ్రేణుల అంతరాలు, సంరక్షణలో తేడాలున్నాయని పత్రం చెబుతుంది. కాబట్టి శ్రేణి పోలిక పరిశీలించదగిన సూచన మాత్రమే; ARTకు CRISPR యంత్రాంగం ఉందనే ఆధారం కాదు.

ప్రయోగాలు ఏమి నిర్ధారించాయి

పరిశోధకులు ఫేజ్ SA1 సంక్రమణపై 2022 అధ్యయనంలోని RNA డేటాను మళ్లీ విశ్లేషించారు. వారి విశ్లేషణలో సంక్రమణ సమయంలో ART శ్రేణి లిప్యంతరీకరణ చెంది, చిన్న RNA రూపాలను ఉత్పత్తి చేసింది. వేరొక ప్రయోగశాల వ్యక్తీకరణ పరీక్షలోనూ శ్రేణి నుంచి వచ్చిన చిన్న RNAలను నివేదించారు. ఇవి ఆ శ్రేణి నుంచి వేర్వేరు RNAలు ఉత్పత్తవుతున్నాయనే విషయానికి మద్దతిస్తాయి.

అయితే ప్రతిపాదిత యంత్రాంగంలోని తదుపరి దశలను అవి నిర్ధారించవు. reverse transcriptase చర్య ఉందని, శ్రేణి RNAలు దాని ఉపపదార్థాలని ఇంకా చూపలేదని ప్రీప్రింట్ చర్చలో రచయితలు స్పష్టంగా చెబుతారు. భాగస్వామి ప్రోటీన్‌తో పరస్పర చర్య, ఫేజ్‌లో ఈ వ్యవస్థ పాత్ర కూడా పరిష్కారం కాలేదు. పత్రంలోని retron-తరహా నమూనా ఒక పరికల్పన మాత్రమే. ART ఎంచుకున్న DNA లక్ష్యాన్ని కోస్తుందని లేదా సవరిస్తుందని ఇంకా చెప్పలేం.

Anthropic, ప్రీప్రింట్‌ను సమీక్షించిన CRISPR పరిశోధకుడు Feng Zhang వ్యాఖ్యను ప్రచురించింది. reverse transcriptaseలతో అనుబంధమున్న RNA-repeat శ్రేణులు ఆసక్తికరమని ఆయన అన్నారు. మరింత పరిశీలనకు అవి అర్హమన్నదే ఆయన స్పష్టమైన నిర్ధారణ. ఇది స్వతంత్ర పునరావృత పరీక్ష నివేదిక కాదు; ART జన్యు-సవరణ సాధనమనే నిర్ధారణా కాదు.

పునరావృతంగా గుర్తించగల పరిమితులతో కూడిన పరిశోధనా సూచన

AI శోధననూ ఈ అధ్యయనం పరీక్షించింది. రచయితలు నివేదించిన పది విస్తృత శోధన పునరావృతాల్లో ఏజెంట్‌లు ఆ శ్రేణిని గుర్తించలేదు. సంబంధిత DNAను మోడల్ సందర్భంలో నేరుగా ఉంచిన ఇరుకైన పరీక్షల్లో బలమైన మోడళ్లు దాన్ని చాలా తరచుగా గుర్తించాయి. శ్రేణి, సాధనాల వెనుక ఉన్న ఫైళ్లలో ఉన్నప్పుడు, నమూనా కనిపించేంత DNAను కొన్ని ప్రయత్నాలు చదవలేదు. తేడా ముఖ్యం: లక్షణాన్ని మోడల్ ఎదుర్కొన్నప్పుడు దాన్ని గుర్తించగలిగింది; కానీ పూర్తి శోధన సరైన శ్రేణిని విశ్వసనీయంగా దాని దృష్టికి తీసుకురాలేకపోయింది.

సంస్థ నేతృత్వంలోని ప్రీప్రింట్, ఇతర పరిశోధకులు సవాలు చేసి విస్తరించగల నిర్దిష్ట శ్రేణి అమరిక, RNA పరిశీలనలను అందిస్తుంది. సెప్టెంబర్ 23 నాటికి ఈ వ్యాసం కోసం పరిశీలించిన మూలాల్లో స్వతంత్ర పునరావృత పరీక్ష నివేదించలేదు. ART పని ఇంకా నిర్ణయించని అభ్యర్థి వ్యవస్థగానే ఉంది.